In silico là gì? Các công bố khoa học về In silico

"In silico" là một thuật ngữ xuất phát từ tiếng Latin, có nghĩa là "trong máy tính". Thuật ngữ này thường được sử dụng trong lĩnh vực khoa học, đặc biệt là tron...

"In silico" là một thuật ngữ xuất phát từ tiếng Latin, có nghĩa là "trong máy tính". Thuật ngữ này thường được sử dụng trong lĩnh vực khoa học, đặc biệt là trong lĩnh vực sinh học, để chỉ các phương pháp và công nghệ sử dụng máy tính để thực hiện các mô phỏng, phân tích, dự đoán và tìm hiểu các quá trình sinh học và hóa học. Các phương pháp "in silico" giúp tiết kiệm thời gian, nguồn lực và chi phí so với các phương pháp truyền thống, đồng thời cung cấp những thông tin quan trọng để hiểu và nghiên cứu các hiện tượng sinh học và hóa học.
"In silico" là một thuật ngữ chỉ việc sử dụng phần mềm và công nghệ máy tính để thực hiện các mô phỏng, phân tích và dự đoán các hiện tượng trong các lĩnh vực như sinh học, hóa học, dược học và y học. Thay vì thực hiện thí nghiệm trực tiếp trên thực tế, các nhà nghiên cứu sẽ sử dụng các mô hình toán học và dữ liệu số để thực hiện các thí nghiệm ảo.

Phương pháp "in silico" bao gồm sử dụng các phần mềm mô phỏng, các công cụ và thuật toán tính toán để tạo ra mô hình số, nhắm mục tiêu nghiên cứu những khía cạnh cụ thể của một quá trình sinh học hoặc hóa học. Các mô hình "in silico" có thể mô phỏng các hiện tượng từ cấp độ phân tử, tế bào, mạng lưới sinh học, đến cấp độ cơ thể hoặc dân số.

Các phương pháp "in silico" được sử dụng trong nhiều lĩnh vực, bao gồm:

1. Mô phỏng phân tử: Sử dụng các công cụ mô phỏng để dự đoán cấu trúc phân tử, tương tác giữa phân tử và dự đoán tính chất của các hợp chất.

2. Dự đoán tác động dược lý: Sử dụng phần mềm và thuật toán để dự đoán tác động của các thuốc và chất hoạt động lên các mục tiêu dược lý, giúp nghiên cứu viên phát triển và tìm kiếm các dược phẩm tiềm năng.

3. Mô phỏng dòng chảy máu và tuần hoàn: Sử dụng các mô hình số để mô phỏng dòng chảy máu trong các mạch máu, tìm hiểu hiệu ứng của huyết áp, dòng chảy và loại bỏ chất có hại.

4. Mô phỏng mạng lưới sinh học: Mô phỏng và phân tích các mạng lưới sinh học phức tạp như mạng lưới tế bào, mạng lưới gene, để hiểu sự giao tiếp giữa các thành phần và tính toán các tác động của các thay đổi trong mạng lưới.

Phương pháp "in silico" đóng vai trò quan trọng trong việc giảm thời gian, nguồn lực và chi phí cần thiết cho nghiên cứu, đồng thời cung cấp những kiến thức quan trọng về các hiện tượng sinh học và hóa học. Tuy nhiên, cần lưu ý rằng các mô hình "in silico" cần được xây dựng và kiểm tra kỹ lưỡng để đảm bảo tính chính xác và đáng tin cậy của kết quả.

Danh sách công bố khoa học về chủ đề "in silico":

High-performance lithium battery anodes using silicon nanowires
Nature Nanotechnology - Tập 3 Số 1 - Trang 31-35 - 2008
Computer simulation of local order in condensed phases of silicon
American Physical Society (APS) - Tập 31 Số 8 - Trang 5262-5271
Determination of the thickness and optical constants of amorphous silicon
IOP Publishing - Tập 16 Số 12 - Trang 1214-1222 - 1983
Silicene: Compelling Experimental Evidence for Graphenelike Two-Dimensional Silicon
Physical Review Letters - Tập 108 Số 15
Phát hiện và định kiểu plasmid bằng cách sử dụng công cụ PlasmidFinder và Đánh giá Đa Vị trí Plasmid Dịch bởi AI
Antimicrobial Agents and Chemotherapy - Tập 58 Số 7 - Trang 3895-3903 - 2014
TÓM TẮT

Trong công trình này, chúng tôi đã thiết kế và phát triển hai công cụ Web dễ sử dụng cho phép tính toán trong môi trường máy tính phát hiện và xác định đặc điểm của chuỗi gen toàn bộ bộ gen (WGS) và dữ liệu chuỗi toàn bộ plasmid từ các thành viên của họ Enterobacteriaceae . Các công cụ này sẽ giúp cho việc định kiểu khuẩn dựa trên bản nháp của bộ gen của các loài đa kháng thuốc thuộc họ Enterobacteriaceae bằng cách phát hiện nhanh chóng các loại plasmid đã biết. Các chuỗi replicon từ 559 plasmid đã được giải mã toàn bộ liên quan đến họ Enterobacteriaceae trong cơ sở dữ liệu nucleotide của NCBI đã được thu thập để tạo cơ sở dữ liệu đồng thuận tích hợp vào công cụ Web gọi là PlasmidFinder, có thể được dùng để phân tích trình tự replicon từ dữ liệu trình tự plasmid thô, nhóm contig, hoặc được lắp ráp hoàn chỉnh và đóng gói. Cơ sở dữ liệu PlasmidFinder hiện bao gồm 116 chuỗi replicon phù hợp với ít nhất 80% độ tương đồng nucleotide với tất cả các chuỗi replicon được xác định trong 559 plasmid đã được giải mã toàn bộ. Đối với phân tích Đa Vị trí Trình tự Plasmid (pMLST), một cơ sở dữ liệu được cập nhật hàng tuần đã được tạo ra từ www.pubmlst.org và được tích hợp vào một công cụ Web gọi là pMLST. Cả hai cơ sở dữ liệu đã được đánh giá bằng cách sử dụng các bộ gen nháp từ một bộ sưu tập của các chủng Salmonella enterica serovar Typhimurium. PlasmidFinder đã xác định tổng cộng 103 replicon và từ không đến năm replicon trong mỗi bộ gen nháp của S . Typhimurium đã được thử nghiệm. Công cụ web pMLST đã có thể xác định phân nhóm dữ liệu trình tự gen của plasmid, tiết lộ cả các loại trình tự plasmid đã biết (STs) và các alen mới cũng như các biến thể ST. Kết luận, thử nghiệm của hai công cụ Web này sử dụng cả trình tự plasmid lắp ráp hoàn chỉnh và các bộ gen nháp tạo ra từ WGS cho thấy khả năng phát hiện một loạt các loại plasmid thường liên quan đến kháng kháng sinh trong các tác nhân gây bệnh vi khuẩn có ý nghĩa lâm sàng.

#phát hiện plasmid #PlasmidFinder #Enterobacteriaceae #Đa Vị trí Trình tự Plasmid (pMLST) #kháng kháng sinh #dữ liệu toàn bộ bộ gen (WGS) #chuỗi plasmid
DrugBank: a comprehensive resource for in silico drug discovery and exploration
Nucleic Acids Research - Tập 34 Số 90001 - Trang D668-D672 - 2006
Quan hệ Tổng quát cho Quá trình Oxy hóa Nhiệt của Silicon Dịch bởi AI
Journal of Applied Physics - Tập 36 Số 12 - Trang 3770-3778 - 1965

Sự động học của quá trình oxy hóa nhiệt của silicon được khảo sát một cách chi tiết. Dựa trên một mô hình đơn giản về quá trình oxy hóa, mô hình này xem xét các phản ứng diễn ra tại hai ranh giới của lớp oxit cũng như quá trình khuếch tán, mối quan hệ tổng quát x02+Ax0=B(t+τ) được rút ra. Mối quan hệ này cho thấy sự phù hợp xuất sắc với dữ liệu oxy hóa thu được trên một dải nhiệt độ rộng (700°–1300°C), áp suất một phần (0.1–1.0 atm) và độ dày oxit (300–20 000 Å) cho cả chất oxy hóa là oxy và nước. Các tham số A, B, và τ được chứng minh là có liên quan đến hằng số vật lý-hóa học của phản ứng oxy hóa theo cách được tiên đoán. Phân tích chi tiết này cũng dẫn đến thông tin thêm về bản chất của các loài được vận chuyển cũng như ảnh hưởng của điện tích không gian lên giai đoạn đầu của quá trình oxy hóa.

#oxy hóa nhiệt #silicon #động học #lớp oxit #khuếch tán #phản ứng #nhiệt độ #áp suất #oxit độ dày #oxy hóa #đặc trưng vật lý-hóa học.
Thuộc tính điện của các màng silicon đa tinh thể Dịch bởi AI
Journal of Applied Physics - Tập 46 Số 12 - Trang 5247-5254 - 1975

Liều lượng boron từ 1×10¹²–5×10¹⁵/cm² được cấy vào các màng polysilicon dày 1 μm ở mức 60 keV. Sau khi nung ở 1100°C trong 30 phút, các phép đo Hall và điện trở được thực hiện ở khoảng nhiệt độ từ −50–250°C. Kết quả cho thấy Hall mobility có mức tối thiểu vào khoảng 2×10¹⁸/cm³ với nồng độ pha tạp. Năng lượng kích hoạt điện được tìm thấy xấp xỉ một nửa giá trị khe năng lượng của silicon đơn tinh thể cho các mẫu pha tạp nhẹ và giảm xuống dưới 0,025 eV ở mức pha tạp 1×10¹⁹/cm³. Nồng độ hạt dẫn rất nhỏ ở mức pha tạp dưới 5×10¹⁷/cm³ và tăng nhanh với sự gia tăng nồng độ pha tạp. Tại mức pha tạp 1×10¹⁹/cm³, nồng độ hạt dẫn đạt khoảng 90% nồng độ pha tạp. Một mô hình ranh giới hạt có bao gồm các trạng thái bắt giữ đã được đề xuất. Nồng độ và độ di động của hạt dẫn theo nồng độ pha tạp và tính di động cùng điện trở theo nhiệt độ được tính toán từ mô hình. Các kết quả lý thuyết và thực nghiệm được so sánh, và thấy rằng mật độ trạng thái bắt giữ tại ranh giới hạt là 3,34×10¹²/cm² nằm tại 0,37 eV phía trên rìa băng hóa trị.

#polysilicon films #boron implantation #electrical properties #Hall mobility #carrier concentration #grain-boundary model #trapping states #annealing conditions
Non-crystalline Structure in Solidified Gold–Silicon Alloys
Nature - Tập 187 Số 4740 - Trang 869-870 - 1960
Tổng số: 35,082   
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • 10